Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms