Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms