Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms