Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms