Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC27A1Q6PCB7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC27A1Q6PCB7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms