Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms