Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPECC1LQ69YQ0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms