Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms