Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms