Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC30Q5VVM6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC30Q5VVM6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms