Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms