Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3CQ5T2N8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms