Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZB4

C9orf50, Uncharacterized protein C9orf50, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50Q5SZB4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf50Q5SZB4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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