Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
LDLRAP1Q5SW96 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms