Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM41BQ5BJD5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms