Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP55Q53EZ4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms