Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms