Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM259Q4ZIN3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms