Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01559Q495D7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms