Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms