Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms