Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms