Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms