Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms