Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms