Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms