Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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