Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
UPP1Q16831 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms