Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
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FOXD1Q16676 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
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FOXD1Q16676 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
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FOXD1Q16676 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
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FOXD1Q16676 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
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FOXD1Q16676 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
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FOXD1Q16676 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
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FOXD1Q16676 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
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FOXD1Q16676 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
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FOXD1Q16676 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
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FOXD1Q16676 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
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FOXD1Q16676 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
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FOXD1Q16676 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
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FOXD1Q16676 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
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FOXD1Q16676 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
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FOXD1Q16676 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FOXD1Q16676 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
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