Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACKR1Q16570 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
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