Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP35Q16560 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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