Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC2Q16515 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ASIC2Q16515 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ASIC2Q16515 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC2Q16515 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC2Q16515 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC2Q16515 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC2Q16515 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC2Q16515 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC2Q16515 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC2Q16515 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC2Q16515 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC2Q16515 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC2Q16515 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC2Q16515 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC2Q16515 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC2Q16515 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC2Q16515 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC2Q16515 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC2Q16515 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC2Q16515 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms