Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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SSX1Q16384 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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SSX1Q16384 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
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SSX1Q16384 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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SSX1Q16384 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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SSX1Q16384 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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SSX1Q16384 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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