Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN9AQ15858 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN9AQ15858 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
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