Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
NCOA1Q15788 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms