Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
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