Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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