Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUM3Q15397 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
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