Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
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