Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCM1Q15154 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms