Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD3Q15054 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms