Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL19A1Q14993 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms