Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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NEDD9Q14511 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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NEDD9Q14511 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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NEDD9Q14511 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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NEDD9Q14511 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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