Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCARF1Q14162 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
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