Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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