Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PDE6HQ13956 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PDE6HQ13956 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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PDE6HQ13956 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PDE6HQ13956 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PDE6HQ13956 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PDE6HQ13956 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PDE6HQ13956 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PDE6HQ13956 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PDE6HQ13956 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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