Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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