Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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C1orf61Q13536 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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C1orf61Q13536 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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C1orf61Q13536 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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C1orf61Q13536 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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C1orf61Q13536 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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C1orf61Q13536 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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C1orf61Q13536 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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C1orf61Q13536 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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