Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
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