Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
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